为什么区分专用和普通？
为了增值税的监控和征收。
一、增值税专用发票
因为一件商品，比如说一个锤子，从王总手里卖给高总，再从高总手里卖给李总，每个人都会加价卖出，每一次交易都会增值，每个人都要根据自己的加价部分交税。
王把10块钱的锤子20元卖给高，高把17.7元价款+2.3元税款=20元付给王，王要开一张专用发票给高，高用来证明自己交过这一趟税了。高再把20元的锤子加价到40元卖给李，李付给高35.4元价款+4.6元税款=40元。
这时候高收到了4.6元的税款，因为这个锤子是他40元卖出去的，法律规定你40元的锤子就是要交4.6元的增值税，不交就打死你。（40÷1.13）×0.13=4.6元。但是你已经交过的税，很显然高已经交过2.3元了，可以用来抵扣，也就是你从王手里买进来时交的那2.3元进项税，可以抵扣这次40元卖给李产生的4.6元销项税，销项税-进项税=4.6元-2.3元=2.3元，所以这次你只需要再交2.3元。
高怎么证明自己已经交过了？税局凭什么相信你已经交过了？增值税专用发票，为证。增值税专用发票是一个个的证据链，证明你交税了没有、交了多少。要证明你买进东西的时候交过税，那就要取得增值税专用发票，用来抵扣将来你卖出东西的时候要交的税。
当然并不是你随便拿一张发票税局就认，所以需要认证，认证完了才给你抵扣。
二、增值税普通发票
普通发票与专用发票最大的区别就是，普通发票不能像专用发票那样，给你抵扣进项税。但也不是完全不能抵扣，农产品、通行费等可以抵扣。
至于为什么不能抵扣，我猜是，一是由于开票主体原因造成的。比如小规模纳税人，不需要针对每一笔销售计算应该缴纳的增值税，而是依据一个固定的3%征收率，直接乘以销售额得出来。这是国家给小规模的照顾。因为他没有区别那个产品交了多少增值税，而是不区分产品，统一以主体销售额乘以固定税率，所以产品自带的增值税就无法追踪，也没必要追踪。卖方拿到这种普通发票，也不用分价款、税金了，直接全部金额计入成本或者费用，去抵扣企业所得税，跟自己的增值税没关系了。
二因为产品特性决定的，可以继续流转的产品，有必要追踪增值税缴纳情况，无法继续流转的，就只能开增值税普通发票了。比如，你买了做锤子的材料，把材料变成锤子再卖出去，材料、锤子是继续变形流转的，有完整的链条，需要追下去、收税收下去。而餐饮类的就不好流转。比如你吃了一顿饭，虽然是为了公司经营而吃的，但是你吃饭就自己消化掉排出去了，不可能自己肚子里加工一会儿再拿去卖给别人，这个不合理。没必要追踪，所以不能抵扣你的进项，因为无法继续流转，只有进项没有销项，国家要吃亏的。你天天吃，把国家都吃穷了。
三、普通发票与专用发票的选择
如果你是小规模纳税人，你肯定愿意开普通发票出去，因为这对你有好处，少交税。你也没必要一点取得专用发票，因为你不能抵扣。
如果你是一般纳税人，你肯定愿意要专用发票，因为可以抵扣税，不让你多交税。如果你向小规模买东西，可以要求他到税务局去申请代开专用发票给你。税金虽然少，一点点积累起来也是蛮多的。
大家都愿意少交，不愿意多交，这个扯皮的过程是很，无奈的。
电子发票的时代已经来了，发票的事，先扯到这里。